Protein–RNA interactions for Protein: Q60687

Fshb, Follitropin subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FshbQ60687 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
FshbQ60687 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
FshbQ60687 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms