Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Satb1Q60611 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms