Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CttnQ60598 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CttnQ60598 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms