Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sin3aQ60520 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sin3aQ60520 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms