Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tdrd5Q5VCS6 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tdrd5Q5VCS6 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms