Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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Trim38Q5SZ99 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Trim38Q5SZ99 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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