Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ccdc42Q5SV66 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc42Q5SV66 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms