Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPX3

Rnf215, RING finger protein 215, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf215Q5SPX3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rnf215Q5SPX3 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Rnf215Q5SPX3 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms