Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trdv2-2Q5R1A4 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms