Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Taf3Q5HZG4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms