Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Frem3Q5H8B9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Frem3Q5H8B9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms