Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SynaQ5G5D5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62 ms