Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm43138-201ENSMUST00000199123 708 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ecm2Q5FW85 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms