Protein–RNA interactions for Protein: Q505F5

Lrrc47, Leucine-rich repeat-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc47Q505F5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrc47Q505F5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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