Protein–RNA interactions for Protein: Q499D0

Foxn3, Forkhead box protein N3, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn3Q499D0 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Foxn3Q499D0 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Foxn3Q499D0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms