Protein–RNA interactions for Protein: Q497I4

Krt35, Keratin, type I cuticular Ha5, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt35Q497I4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Krt35Q497I4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms