Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 4921507P07Rik-201ENSMUST00000031852 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
4930518I15RikQ3V2W7 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms