Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1D3

Ampd1, AMP deaminase 1, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ampd1Q3V1D3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ampd1Q3V1D3 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ampd1Q3V1D3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms