Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm18595-201ENSMUST00000175736 1068 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm45079-201ENSMUST00000205627 461 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrrc43Q3V0L5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Lrrc43Q3V0L5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms