Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc9Q3V038 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc9Q3V038 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc9Q3V038 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Ttc9Q3V038 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ttc9Q3V038 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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