Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
E330034G19RikQ3UWX6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
E330034G19RikQ3UWX6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms