Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Capn13Q3UW68 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Capn13Q3UW68 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms