Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Nr1d1Q3UV55 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Nr1d1Q3UV55 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms