Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm34272-201ENSMUST00000208886 253 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Olfr967-202ENSMUST00000213358 1210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 AC154828.2-201ENSMUST00000220908 1070 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm17790-201ENSMUST00000191545 1228 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Skap1Q3UUV5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms