Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm29609Q3UU56 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Gm29609Q3UU56 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm29609Q3UU56 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm29609Q3UU56 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm29609Q3UU56 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms