Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm28047Q3US59 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms