Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
D13Ertd608eQ3UPR8 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
D13Ertd608eQ3UPR8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms