Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tmem253Q3UNB8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms