Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccdc33Q3ULW6 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms