Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b2Q3UJB0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b2Q3UJB0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms