Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Snx27Q3UHD6 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms