Protein–RNA interactions for Protein: Q3UA06

Trip13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip13Q3UA06 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trip13Q3UA06 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trip13Q3UA06 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms