Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Cops9Q3U898 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cops9Q3U898 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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