Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ssbp4Q3U4B1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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