Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Palb2Q3U0P1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms