Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Srsf6Q3TWW8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
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