Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLI0

Trappc10, Trafficking protein particle complex subunit 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc10Q3TLI0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trappc10Q3TLI0 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms