Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trim43aQ3TL54 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms