Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Hddc2Q3SXD3 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Hddc2Q3SXD3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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