Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNP5

V1rd19, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1rd19Q3KNP5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
V1rd19Q3KNP5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms