Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M3Q31093 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M3Q31093 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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