Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWQ2

Nell1, Protein kinase C-binding protein NELL1, mousemouse

Predictions only

Length 810 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell1Q2VWQ2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Nell1Q2VWQ2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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