Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Specc1lQ2KN98 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms