Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Cers3Q1A3B0 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
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Cers3Q1A3B0 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cers3Q1A3B0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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