Protein–RNA interactions for Protein: Q14C51

Ptcd3, Pentatricopeptide repeat domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptcd3Q14C51 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ptcd3Q14C51 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ptcd3Q14C51 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms