Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Traf3ip1Q149C2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Traf3ip1Q149C2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms