Protein–RNA interactions for Protein: Q0GGX2

Znf541, Zinc finger protein 541, mousemouse

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf541Q0GGX2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Znf541Q0GGX2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Znf541Q0GGX2 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms