Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Slc7a1Q09143 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Slc7a1Q09143 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms