Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Cass4Q08EC4 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cass4Q08EC4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms