Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Q08AU9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.48
Q08AU9 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Q08AU9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms